A zártkörű alapítású MECSEKÉRC Környezetvédelmi Zártkörűen Működő Részvénytársaság a Mecseki Ércbányászati Vállalat átalakulásával, annak jogutódjaként jött létre 1998. április 30-án. A társaság alapítója és egyszemélyes tulajdonosa a Magyar Nemzeti Vagyonkezelő Zrt. (MNV Zrt.). A MECSEKÉRC Zrt.-ből 2004. november 30-án kivált a MECSEK-ÖKO Zrt., mint a bánya-rekultivációs állami feladatokat folytató, szintén MNV Zrt. tulajdonú vállalat.